Rüdiger Junkert wurde 1941 in Bamberg geboren, verbrachte hier auch seine Schulzeit und studierte nach dem Abitur Rechtswissenschaften in Erlangen und München.
Nach dem ersten Staatsexamen im Jahr 1965 und dem Referendariat in Bamberg und Bayreuth legte er im Jahr 1968 sein zweites Staatsexamen ab.
Zunächst war er als Gerichtsassessor und Staatsanwalt in Bamberg tätig, im Jahr 1971 wurde er als Rechtsanwalt zugelassen und trat in die Rechtsanwaltssozietät Wagner-Röschert ein, in der er bis 2024 praktizierte.
Rüdiger Junkert war Mitglied der Deutschen Gesellschaft für Erbrechtskunde e.V, des deutschen Anwaltsvereins, der Arbeitsgemeinschaft Familien- und Erbrecht im Deutschen Anwaltsverein und im Anwaltsverein Bamberg, dessen erster Vorsitzender er von 1985-1993 war.
Seit Ende 2024 befindet sich Rüdiger Junkert im Ruhestand und ist nicht mehr aktiv als Rechtsanwalt tätig.